Emma Emmerich-Danziger est la demi-soeur d'Otacon : il l'appelle affectueusement "E.E". Ils étaient très proche l'un de l'autre, jusqu'à ce qu'un incident tragique amène à se séparer. Emma est une surdouée, spécialiste dans le domaine de l'intelligence artificiel; c'est elle qui a conçu le système sur lequel repose Metal Gear Ray. Cette réussite scientifique lui offre la possibilité de concrétiser un vieux rêve : battre son grand frère sur son propre terrain. Elle veut le punir de l'avoir abandonnée alors qu'elle avait seulement six ans.
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