Frank Jaeger est un métis, moitié vietnamien, moitié germano-américain. Ses parents étant décédés lors de la guerre du Vietnam, il devient le fils adoptif de Big Boss. Il suit la voie tracée par son père, donc un entraînement poussé afin de devenir une véritable machine à tuer. Ce qui l'amène, dès son adolescence, à adopter le statut de mercenaire et prendre part à divers conflits, comme la lutte pour l'indépendance de la Rhodésie. Il est ensuite fait prisonnier lors d'une opération au Mozambique, où il connaît les affres de la torture. Big Boss réussit à le délivrer de ses bourreaux, puis il part aux Etats-Unis, où la nationalité américaine lui est accordée, ce qui lui permet de rejoindre FOXHOUND.

C'est au sein de cette unité d'élite, dans les années 90, qu'il fait preuve d'un dévouement total, et d'une reconnaissance sans limite envers son père, qui dirige alors FOXHOUND. Il est d'ailleurs reconnu comme son membre le plus méritant et obtient son nom de code : Gray Fox. Solid Snake, à l'époque, dernière recrue de l'unité, sauve la vie de Gray Fox au cours de la crise de Outer Heaven en 1995. Ironie du sort, il devient en 1999 l'ennemi de son sauveur, lorsque Solid Snake intervient dans l'émeute de Zanzibar. Frank Jaeger perd à la suite de ce conflit environ 30% de son corps, mais survit miraculeusement alors que tout le monde le croit mort. La rumeur est qu'il serait en fait toujours vivant, et qu'i aurait eu recours à la thérapie génique afin de modifier les parties endommagées de son corps. Il devient ainsi le ninja, personnage directement sorti de l'imagination de Yoji Shinkawa.

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